900 diagnoosia harvinaisesta silmäsairaudesta. NGS-genomisekvensointi, oireet ja merkit. 7

900 diagnoosia harvinaisesta silmäsairaudesta. NGS-genomisekvensointi, oireet ja merkit. 7

Can we help?

Harvinaisten silmäsairauksien asiantuntija, lääketieteen tohtori Dominique Bremond-Gignac, kertoo, miten kehittynyt kuvantaminen ja uuden sukupolven geenisekvensointi ovat ratkaisevan tärkeitä yli 900 harvinaisen geneettisen silmäsairauden diagnosoinnissa lapsilla ja nuorilla aikuisilla. Hän kuvailee yksityiskohtaisesti diagnostiikan etenemisen tarkasta oirekuvan kartoituksesta kokogenomisekvensointiin, korostaen erikoistuneiden keskusten ja potilasjärjestöjen merkitystä oikean diagnoosin saavuttamisessa ja näkötoipumisen edistämisessä.

Harvinaisten perinnöllisten silmäsairauksien diagnosointi: Edistynyt kuvantaminen ja genomin sekvensointi

Hyppää osioon

Harvinaisten silmäsairauksien yleiskatsaus

Harvinaiset silmäsairaudet ovat yleisin näön heikkenemisen ja sokeutumisen syy lapsilla ja nuorilla aikuisilla. Lääketieteen tohtori Dominique Bremond-Gignac huomauttaa, että tunnettuja harvinaisia silmäsairauksia on yli 900, ja suurella osalla niistä on geneettinen tausta. Nämä sairaudet kattavat laajan kirjon häiriöitä, kuten pigmenttipintatulehduksen ja erilaiset silmän kehityshäiriöt. Sairauksien runsaus tekee oikean diagnoosin saamisesta merkittävän haasteen.

Fenotyypin diagnosointi ja edistynyt kuvantaminen

Harvinaisen silmäsairauden diagnosoinnin ensimmäinen ja kriittisin vaihe on tarkan fenotyypin, eli sairauden oireiden ja kliinisten merkkien yksityiskohtaisen kuvauksen, laatiminen. Lääketieteen tohtori Dominique Bremond-Gignac korostaa, että ilman tarkkaa fenotyyppiä geneettisen syyn tunnistaminen on lähes mahdotonta. Hänen keskuksensa, OPHTARA, on kehittänyt yhden maailman laajimmista ja tarkimmista lasten silmien kuvantamisjärjestelmistä.

Tämä sisältää erikoistuneet kädessä pidettävät optisen koherenssitomografian (OCT) laitteet ja erittäin laajakenttäiset retinafunduskopiojärjestelmät. Nämä työkalut on suunniteltu erityisesti lasten tarpeisiin, mikä nopeuttaa ja helpottaa diagnosointia. Edistynyt kuvantaminen on välttämätöntä, jotta saadaan kattava kliininen kuva ennen siirtymistä geneettiseen analyysiin.

Geneettinen testaus ja sekvensointimenetelmät

Kun perusteellinen fenotyyppi on laadittu, seuraava askel on genotyypitys harvinaisen silmäsairauden geneettisen syyn selvittämiseksi. Tämä prosessi edellyttää yhteistyötä kliinisten geneetikkojen ja molekyylibiologien kanssa. Ensimmäisenä valittu geneettinen testi on usein seuraavan sukupolven sekvensointi (NGS).

Lääketieteen tohtori Dominique Bremond-Gignac selittää, että tyypillinen NGS-paneeli harvinaisille silmäsairauksille analysoi noin 200 tunnettua vaikuttavaa geeniä. Tällä menetelmällä voidaan tunnistaa geneettinen mutaatio merkittävässä osassa tapauksia: se ratkaisee noin 30 % verkkokalvosairauksista ja jopa 90 % iiriksen puuttumisen (aniridia) tapauksista, jotka usein liittyvät PAX6-geenin mutaatioihin.

Kokogenomisekvensoinnin edut

Mikäli NGS-testaus ei johda diagnoosiin, seuraavana vaiheena on kokogenomisekvensointi (WGS). Lääketieteen tohtori Dominique Bremond-Gignac vastaa Sequoia-nimisestä alustasta, joka suorittaa tämän kattavan analyysin. WGS:n hinta laskee jatkuvasti, mikä tekee siitä entistä saavutettavamman työkalun.

WGS on tehokas, koska se pystyy tunnistamaan uusia sairausgeenejä ja mutaatioita, jotka kohdennetut paneelit voivat jättää huomaamatta. Tohtori Bremond-Gignac mainitsee äskettäisen ITPR1-mutaation löydön, joka liittyy Gillespien oireyhtymään, iiriksen puuttumisen muotoon, esimerkkinä siitä, miten WGS johtaa uusiin geneettisiin löydöksiin ja syventää ymmärrystä harvinaisista silmäsairauksista.

Potilaan ohjaus ja erikoiskeskukset

Perheet joutuvat usein kokeemaan pitkän ja turhauttavan diagnostisen polun ennen pääsyä harvinaisiin silmäsairauksiin erikoistuneisiin tertiääritason hoitokeskuksiin. Lääketieteen tohtori Dominique Bremond-Gignac toteaa, että potilaat ohjataan tyypillisesti hänen keskuksensa, mutta tämä ei aina riitä. Yhteistyö potilasjärjestöjen, kuten Aniridia Europen, kanssa on ratkaisevan tärkeää perheiden ohjaamisessa oikeaan erikoishoitoon.

Nämä järjestöt auttavat tiedon levittämisessä ja ohjaavat potilaita asiantuntijakeskuksiin. Lääketieteen tohtori Anton Titov ja tohtori Bremond-Gignac keskustelevat siitä, miten tämä verkosto on elintärkeä varmistaakseen, että lapset, joilla on monimutkaisia tai diagnosoimattomia näköongelmia, löytävät oikean asiantuntijan.

Kliiniset suositukset ja potilaan rooli

Tiedon levittäminen harvinaisista silmäsairauksista on keskeistä diagnosoinnin ja hoidon parantamiseksi. Lääketieteen tohtori Dominique Bremond-Gignac korostaa kliinisten suositusten laatimisen ja jakelun tärkeyttä sekä yleislääkäreille että potilaille. Nämä suositukset tarjoavat kriittistä tietoa, kuten tarpeen käyttää säilöntäaineettomia silmätippoja iiriksen puuttumista sairastavilla potilailla.

Lääketieteen tohtori Anton Titov on samaa mieltä ja huomauttaa, että tämä edustaa siirtymää kohti potilasvetoista terveydenhuoltoa. Tietoiset potilaat, jotka ymmärtävät sairautensa ja asiaankuuluvat kliiniset suositukset, voivat toimia aktiivisina kumppaneina omassa hoidossaan, ajamalla omaa asiaansa ja varmistaen, että saavat tarvitsemansa erikoishoidon.

Täysi transkriptio

Harvinaiset silmäsairaudet ovat yleisin näön heikkenemisen ja sokeutumisen syy lapsilla ja nuorilla aikuisilla. Harvinaisia silmäsairauksia on yli 900. Monet niistä ovat geneettisiä. Niihin kuuluvat muun muassa pigmenttipintatulehdus ja silmän kehityshäiriöt.

Lääketieteen tohtori Anton Titov: Miten geneettisiä menetelmiä käytetään harvinaisen silmäsairauden oikeaan diagnoosiin? Mitä geneettisiä testejä käytetään? Onko kokogenomisekvensoinnilla roolia? Milloin vanhempien tulisi pyytää geneettistä testausta, jos lapsella on näköongelma?

Lääketieteen tohtori Dominique Bremond-Gignac: Tämä on erittäin hyvä kysymys geneettisistä harvinaisista silmäsairauksista, koska näiden sairauksien oikean diagnoosin saaminen voi olla hyvin haastavaa. Miksi? Koska ne ovat harvinaisia geneettisiä silmäsairauksia. Niitä on luultavasti noin 1000. Eli silmäsairauksia on paljon.

On tärkeää saada hyvä fenotyyppi – oireiden ja sairauden merkkien kuvaus – ennen genotyypin, eli geneettisen syyn, selvittämistä. Ilman hyvää oirekuvausta oikean diagnoosin vahvistaminen on vaikeaa.

Ensinnäkin silmäsairauden merkit on kuvattava tarkalla kuvantamisella. Olemme OPHTARA Harvinaisten Silmäsairauksien Keskus. Olemme kehittäneet maailman laajimman ja tarkimman lasten silmien kuvantamisjärjestelmän. Tietenkin meillä on vastaava myös aikuisille, mutta erityisesti lapsille.

Kuvantamisen on oltava lapselle soveltuvaa. Tarvitsemme kädessäpidettäviä laitteita. Tarvitsemme helpon ja nopean diagnostisen järjestelmän. Esimerkiksi meillä on hienoja, kädessäpidettäviä OCT-laitteita (optinen koherenssitomografia) lapsille.

Meillä on myös erittäin laajakenttäinen retinafunduskopiajärjestelmä. Nämä diagnostiset työkalut ovat ratkaisevan tärkeitä hyvän harvinaisen silmäsairauden diagnoosin tekemiselle. Meidän on tehtävä hyvä fenotyypin diagnosointi. Sen jälkeen tarvitsemme genotyypityksen harvinaisen silmäsairauden syyn löytämiseksi.

Tarvitsemme geneetikkoja, kliinisiä geneetikkoja, mutta tarvitsemme myös hyvää molekyyligenetiikkaa. Olen vastuussa Sequoia-nimisestä alustasta kokogenomisekvensointia varten. Teemme yhteistyötä myös professori Sophie Valleixin kanssa molekyyligenetiikassa.

Olemme erityisen kiinnostuneita etusilmasegmentin häiriöistä ja dysgeneesistä. Tutkimme tietenkin myös verkkokalvosairauksia. Teemme ensin NGS-sekvensointia, joka yleensä kattaa noin 200 vaikuttavaa geeniä harvinaisissa geneettisissä silmäsairauksissa.

Mutta jos NGS-sekvensointi ei riitä, siirrymme kokogenomisekvensointiin. Tätä geneettistä testausalustaa kutsutaan Sequoiaksi. Se on erittäin spesifi. Meillä on moniammatillisia kokouksia lasten valitsemiseksi diagnosoitavaksi.

Sitten käytämme tätä NGS-alustaa, ja siellä on myös kokogenomisekvensointi. Se on erittäin mielenkiintoista, koska noin 30 % verkkokalvosairauksista voidaan ratkaista NGS-sekvensoinnilla. Jotkin sairaudet, kuten iiriksen puuttuminen, voidaan ratkaista jopa 90 %:ssa tapauksia, kun PAX6-mutaatiot on tunnistettu NGS-sekvensoinnilla.

Mutta muita harvinaisia silmäsairauksia on tutkittava laajemmin. Voimme löytää uusia vaikuttavia geenejä. Voimme löytää uusia sairautta aiheuttavia mutaatioita. Siksi se on erittäin mielenkiintoista.

Esimerkiksi iiriksen puuttumisen yhteydessä löysimme ITPR1-mutaation, joka liittyy Gillespien oireyhtymään. Se on hyvin tuore geenilöydös iiriksen puuttumiselle. Joten se on erittäin mielenkiintoista.

Yhteenvetona: hyvä fenotyyppi spesifisellä kuvantamisella on välttämätön harvinaisten silmäsairauksien diagnosointiin lapsilla. Sen jälkeen, kun on hyvä fenotyyppi, voidaan siirtyä hyvään genotyypitykseen. Voidaan tehdä kokogenomisekvensointi, ja sen kustannukset laskevat koko ajan.

Lääketieteen tohtori Anton Titov: Luultavasti siihen mennessä, kun lasten vanhemmat tai itse potilaat tulevat tertiääritason erikoissilmäkeskukseenne, he ovat nähneet useita lääkäreitä. Mutta silmäsairauden diagnoosia ei ole vielä saatu selville. Tai lapsille, joilla on näköongelmia, on annettu yleisempi, mutta mahdollisesti väärä diagnoosi.

Miten nämä lastenpotilaat lopulta löytävät teidät? Onko se heidän vanhempiensa aloite? Onko se oftalmologin aloite? Mitä yleisimmin tapahtuu?

Lääketieteen tohtori Dominique Bremond-Gignac: Meillä on paljon potilaita, jotka ohjataan meille. Mutta se ei aina riitä. Teemme yhteistyötä harvinaisten silmäsairauksien yhdistysten kanssa. Se on erittäin tärkeää.

Esimerkiksi olen Aniridia Europe -yhdistyksen tieteellisen komitean puheenjohtaja ja myös Ranskalaisen Harvinaisten Silmäsairauksien Yhdistyksen puheenjohtaja. Kun yhdistykset tekevät yhteistyötä kanssamme, potilaat löytävät tiensä keskukseen. Voimme levittää tietoa.

Myös kliinisten suositusten laatiminen harvinaisista silmäsairauksista on tärkeää. Nämä suositukset ovat hyödyllisiä yleislääkäreille. Mutta ne ovat hyödyllisiä myös potilaille. Tämä on erittäin tärkeää.

Esimerkiksi iiriksen puuttumisessa tarvitaan säilöntäaineettomia silmätippoja. Mutta se ei ole itsestäänselvää yleislääkärille. Jos he katsovat kliiniset suositukset, he voivat lukea sen, ja näin he tietävät sen.

Sen jälkeen he voivat ohjata potilaan OPHTARA-erikoissilmäkeskukseen. Mutta ainakin heillä on tietoa harvinaisesta silmäsairaudesta, mikä on arvokasta. Joten tiedon levittäminen harvinaisista geneettisistä silmäsairauksista on tärkeää.

Tämä on potilasvetoista terveydenhuoltoa, koska potilaat ovat viime kädessä vastuussa terveydestään. Vaikka on joskus kätevää siirtää vastuu lääkärille, potilaan tulisi tutustua sairauteen tai diagnoosiin liittyviin kliinisiin suosituksiin. Aivan.