Kaksoisgenomisen sekvensoinnin käyttö leukemiassa: Syöpäsolujen ja perimän analyysi

Hyppää osioon

• Miksi sekvensoida sekä syöpäsoluja että terveitä soluja
• Sekvensoinnin kohdeaine syöpäsoluille
• Perimän sekvensoinnin kasvava merkitys
• Miten perimän sekvensointi suoritetaan
• Perinnöllisen syövän löydösten kliiniset seuraukset
• Tarkkalääketiede käytännössä

Miksi sekvensoida sekä syöpäsoluja että terveitä soluja

Genominsekvensointi, mukaan lukien uuden sukupolven sekvensointi (NGS) ja kokoeksomisekvensointi (WES), on nykyään vakiintunut osa syöpähoitoa. Lääketieteen tohtori Shai Izraeli korostaa, että sekvensointi on suoritettava kahdelle eri näytetyypille: syöpäkudokselle ja potilaan terveille soluille. Tämä kaksoisnäytteenottostrategia on keskeinen nykyaikaisessa tarkkalääketieteessä, sillä merkittävä osa syövistä on perinnöllisiä. Molempien näytteiden sekvensointitiedot ovat ratkaisevan tärkeitä tehokkaan hoidon räätälöinnissä ja syöpäriskin arvioinnissa potilaan laajennetussa perheessä.

Sekvensoinnin kohdeaine syöpäsoluille

Leukemiapotilailla syöpägenomin sekvensointiin käytetään tyypillisesti luuydin- tai verinäytettä. Kuten lääketieteen tohtori Shai Izraeli selittää, on ratkaisevan tärkeää sekvensoida itse leukemiaan liittyvät solut, jotta voidaan tunnistaa ajurigeenimuutokset, kuten Philadelphia-kromosomipositiivisessa leukemiassa esiintyvä BCR-ABL-fuusio. Nämä hankitut mutaatiot ovat syöpätyypille ominaisia ja toimivat ensisijaisina kohteina tarkkahoidoille. Syöpäsolujen rikastaminen on välttämätöntä, jotta NGS-data on tarkkaa ja kliinisesti hyödynnettävissä diagnosoinnissa ja hoidon valinnassa.

Perimän sekvensoinnin kasvava merkitys

Kasvainten lisäksi perimän sekvensointi on nousemassa yhä tärkeämmäksi osaksi syöpähoidon arkea. Lääketieteen tohtori Shai Izraeli viittaa kasvavaan näyttöön siitä, että genetiikalla on merkittävä rooli sekä lasten että aikuisten syövissä. Tutkimusten mukaan jopa 15 % lasten syövistä on perinnöllisiä. Tämä havainto on erityisen tärkeä hoidon suunnittelussa, erityisesti kun harkitaan luuydinsiirtoa sisarusluovuttajalta, joka saattaa kantaa samaa syöpäalttiutta aiheuttavaa mutaatiota. Perimän sekvensointi tarjoaa täydellisen geneettisen kuvan, joka on välttämätön potilaan ja perheen turvallisuuden takaamiseksi.

Miten perimän sekvensointi suoritetaan

Perimän sekvensointi analysoi potilaan periytynyttä DNA:ta, joka parhaiten saadaan syövättömistä soluista. Verisyöpätapauksissa lääketieteen tohtori Shai Izraeli huomauttaa, että yleinen lähde on ihonäyte, josta viljellään fibroblasteja. Toimenpide integroidaan usein saumattomasti lasten hoitosuunnitelmaan, sillä lapset joutuvat usein nukutuksen alle keskuslaskimokatetrin asettamiseksi kemoterapiaa varten. Pienen ihonäytteen ottaminen tässä kivuttomassa toimenpiteessä mahdollistaa puhtaan näytteen normaalista DNA:sta perimän NGS-analyysiä varten, varmistaen nuorelle potilaalle mahdollisimman mukavan kokemuksen.

Perinnöllisen syövän löydösten kliiniset seuraukset

Perinnöllisen syöpäoireyhtymän tunnistaminen perimän sekvensoinnin avulla vaikuttaa välittömästi ja laajalti kliiniseen työhön. Kuten lääketieteen tohtori Shai Izraeli yksityiskohtaisesti kuvaa, tämä tieto voi suoraan vaikuttaa hoidon intensiteettiin ja kantasolusiirron luovuttajan valintaan, estäen sisaruksen käytön, joka kantaa samaa korkean riskin mutaatiota. Lisäksi syöpäalttiutta aiheuttavan mutaation tunnistaminen mahdollistaa geneettisen neuvonnan ja laajennetun perheen jäsenten seulonnan. Tämä ennakoiva lähestymistapa mahdollistaa varhaisen havaitsemisen ja ennaltaehkäisevät toimet riskialttiille sukulaisille, muuttaen perustavanlaatuisesti koko perheen terveyspolkua.

Tarkkalääketiede käytännössä

Sekä syöpä- että normaalikudosten sekvensoinnin hyödyntäminen on tarkkalääketieteen konkreettinen ilmentymä. Lääketieteen tohtori Shai Izraeli kuvailee tätä kaksoisnäytteenottostrategiaa tehokkaaksi työkaluksi, joka on johtanut merkittäviin parannuksiin, mukaan lukien äskettäiset menestykset hänen keskuksessaan. Analysoimalla kattavasti koko geneettisen maiseman – sekä leukemiaan liittyvät hankitut mutaatiot että perimän DNA:ssa olevat periytyvät mutaatiot – onkologit voivat tarjota erittäin personoitua ja tehokasta hoitoa. Tämä strategia varmistaa, että hoito ei ole ainoastaan kohdennettu syöpää vastaan, vaan myös turvallista ja perustuu potilaan täydelliseen geneettiseen perimään.

Koko transkriptio

Kasvainten genominsekvensointi (NGS, WES) on nykyään yleistä. Mutta miksi on tarpeen sekvensoida sekä syöpäkudosnäyte että potilaan normaalit solut (usein ihosolut, fibroblastit)? Merkittävä osa syövistä on perinnöllisiä. NGS-tiedolla voi olla merkitystä hoidolle ja potilaan laajennetun perheen jäsenille.

Lääketieteen tohtori Anton Titov: Teet lasten leukemiasoluille uuden sukupolven genominsekvensointia (NGS). Mikä on sekvensoinnin kohdeaine? Onko se verinäyte? Vai luuydinnäyte?

Lääketieteen tohtori Shai Izraeli: Tämä on monimutkainen kysymys, jonka jaan kahteen osaan. Annan esimerkin Philadelphia-tyyppisistä leukemioista, joissa on BCR-ABL-fuusioita. Nämä geneettiset mutaatiot (kromosominsiirrot) löytyvät leukemiasoluista. On erittäin tärkeää sekvensoida itse syöpäsolut.

Lääketieteen tohtori Anton Titov: Pitääkö soluja rikastaa syövän uuden sukupolven sekvensointia (NGS) varten?

Lääketieteen tohtori Shai Izraeli: Kyllä. Saatan myöhemmin kertoa uskomattoman esimerkin lapsen syövän parantumisesta, joka meillä oli äskettäin keskuksessamme. Tuo parantuminen osoittaa myös syöpägeenien sekvensoinnin tärkeyden.

Myös toinen asia on tulossa yhä tärkeämmäksi. Opimme, että genetiikalla on yhä suurempi merkitys lasten ja aikuisten syövissä.

Arvelemme, että jopa 15 % lasten syövistä on perinnöllisiä. Tämä on tärkeää! Koska syöpäpotilaalle saattaa olla tarpeen tehdä luuydinsiirto veljeltä tai sisarelta. Mutta heillä saattaa myös olla syöpäalttiutta aiheuttava mutaatio.

Perimän sekvensointi yleistyy jatkuvasti. Perimä tarkoittaa ei-leukemiasoluja. Verisyövissä sekvensoimme usein ihosoluja. Sekvensoimme ihosoluja fibroblastiviljelmästä.

Ihonäytteiden ottaminen lapsilta on hyvin yleistä. Koska asetamme heille keskuslaskimokatetreja syövän hoitoon. Keskuslaskimokatetrit asetetaan nukutuksessa. Uskomme, että tämä on kivuton sairaala; teemme kaiken nukutuksessa. Sitten otamme samalla myös ihonäytteen.

Perimän sekvensointi ihosta yleistyy jatkuvasti. Löydämme perheistä perinnöllisiä syöpiä. Sekvensoimme molempia kudostyyppejä. Teemme sekvensointia syöpäleukemiasoluille luuytimestä. Sekvensoimme myös normaalit solut perimästä. Ne tulevat yleensä ihon fibroblasteista.

Lääketieteen tohtori Anton Titov: Nämä ovat todellisia esimerkkejä tarkkalääketieteestä! Kyllä.